De Stichting Waarborgfonds Eigen Woningen (WEW) is op 10 november 1993 opgericht door het voormalige Ministerie van VROM en de Vereniging van Nederlandse Gemeenten (VNG). Achtergrond hiervan was de wens van het Rijk en de gemeenten om te komen tot verzelfstandiging van het instrument gemeentegarantie met rijksdeelneming. Per 1 januari 1995 was deze verzelfstandiging een feit met de introductie van de Nationale Hypotheek Garantie (NHG).
De Stichting Waarborgfonds Eigen Woningen is een private instelling. De raad van commissarissen bestaat uit vertegenwoordigers van het ministerie van VROM, Vereniging van Nederlandse Gemeenten (VNG), Nederlandse Vereniging van Banken (NVB) en vereniging eigen huis (veh). De Stichting is verantwoordelijk is voor het opstellen van de voorwaarden en normen, innen van de borgtochtprovisie, uitkeren van borgstellingen en het beheren van het fondsvermogen. Verder houdt zij langs diverse kanalen belanghebbenden op de hoogte van relevante regelingen en ontwikkelingen.